Program Studi Magister Filsafat STFSP adalah pusat pendidikan filsafat di Indonesia Timur yang menghasilkan insan Magister Filsafat yang mampu mengembangkan Ilmu Filsafat, mampu memecahkan persoalan kemanusiaan berlandaskan pada kearifan lokal dan spiritualitas Kristiani, dan mampu mengolah penelitian dan pengembangannya yang bermanfaat bagi masyarakat dan keilmuan.
